Výběr nádrže do značné míry závisí na vyráběném produktu:
Otevřené vs. uzavřené: Tradiční fermentace vína a některých divokých piv mohou stále používat nádoby s otevřeným víkem-, ale uzavřené nádrže jsou průmyslovým standardem pro sterilitu a kontrolu.
Cylindroconical Fermenters (CCF): Tahoun pivovarského průmyslu. Jejich vysoký, kónický design je prostorově-efektivní a ideální pro hospodaření s kvasinkami.
Horizontální nádrže: Často se používají pro ležení (zrání) nebo výrobu vína-, protože mají větší povrch a menší kontakt s kvasinkami.
Unitank: Univerzální cylindrokónický tank, který zvládne fermentaci, úpravu a sycení oxidem uhličitým vše v jedné nádobě, což zjednodušuje proces.
Bioreaktory: Ve farmaceutické výrobě a výrobě biopaliv se jedná o vysoce sofistikované fermentory s extrémní přesností pro provzdušňování, míchání a monitorování buněčných kultur.
